Genetisk markørpanel

Helgenom-sekvensering av Arktisk røye

I 2018 ble Klosser Innovasjon bevilget støtte fra Regionale forskningsfond Innlandet til å lage et genetisk markørpanel for arktisk røye. Dette verktøyet gir mulighet til å rekonstruere fiskenes slektstre, beregne genetisk diversitet og gi en formening om den utvalgte avlskjernen kommer fra mange nok foreldrefisk til å ikke gi innavlsproblematikk ved senere kryssing.

I tillegg til å konstruere dette skal vi gjøre et søk etter noen markører for tidlig kjønnsmodning på på plasser i genomet det er funnet for andre laksefisk. Hvem vet, kanskje vi har flaks?

30 prøver fra fiskene i avlsprosjektet Arctic Red ble sendt til Norwegian Sequencing Centre, og helgenomsekvensert for å finne genetiske markører (SNPs), hvorpå Centre of Integrative Genetics (Cigene v/ NMBU) setter sammen et passende markørpanel.  Andre samarbeidspartnere er Høgskolen i Innlandet, og Aninova AS som skal hjelpe med dataanalyse

Nå blir det fryktelig spennende å kikke på hva slags genetikk som er kommet med i avlsprosjektet, og om det går an å få en pekepinn på om fisken kjønnsmodner for tidlig, på et tidligere stadium i fiskens livsløp.

Foto: Biobank

Siden ble sist oppdatert: 3. juni 2020 - 09:39;