Genetisk markørpanel
Helgenom-sekvensering av Arktisk røye
I 2018 ble Klosser Innovasjon bevilget støtte fra Regionale forskningsfond Innlandet til å lage et genetisk markørpanel for arktisk røye. Dette verktøyet gir mulighet til å rekonstruere fiskenes slektstre, beregne genetisk diversitet og gi en formening om den utvalgte avlskjernen kommer fra mange nok foreldrefisk til å ikke gi innavlsproblematikk ved senere kryssing.
I tillegg til å konstruere dette skal vi gjøre et søk etter noen markører for tidlig kjønnsmodning på på plasser i genomet det er funnet for andre laksefisk. Hvem vet, kanskje vi har flaks?
30 prøver fra fiskene i avlsprosjektet Arctic Red ble sendt til Norwegian Sequencing Centre, og helgenomsekvensert for å finne genetiske markører (SNPs), hvorpå Centre of Integrative Genetics (Cigene v/ NMBU) setter sammen et passende markørpanel. Andre samarbeidspartnere er Høgskolen i Innlandet, og Aninova AS som skal hjelpe med dataanalyse
Nå blir det fryktelig spennende å kikke på hva slags genetikk som er kommet med i avlsprosjektet, og om det går an å få en pekepinn på om fisken kjønnsmodner for tidlig, på et tidligere stadium i fiskens livsløp.
Foto: Biobank