Genetisk markørpanel

Helgenom-sekvensering av Arktisk røye

Tidligere i år (2018) ble Klosser Innovasjon (tidligere Hedmark Kunnskapspark) bevilget støtte fra Regionale forskningsfond Innlandet til å lage et genetisk markørpanel for arktisk røye. Dette verktøyet gir mulighet til å rekonstruere fiskenes slektstre, beregne genetisk diversitet og gi en formening om den utvalgte avlskjernen kommer fra mange nok foreldrefisk til å ikke gi innavlsproblematikk ved senere kryssing.

I tillegg til å konstruere dette skal vi gjøre et søk etter noen gener for rask vekst på samme plass i genomet som det er funnet for brunørret. Hvem vet, kanskje vi har flaks?

30 prøver fra fiskene i avlsprosjektet Arctic Red er nå sendt til Norwegian Sequencing Centre, og skal helgenomsekvenseres for å finne genetiske markører (SNPs), hvorpå Centre of Integrative Genetics (Cigene v/ NMBU) skal sette sammen et passende markørpanel.  Andre samarbeidspartnere er Høgskolen i Innlandet, og Aninova AS som skal hjelpe med søket etter vekstgener og analyse av data.

Nå blir det fryktelig spennende å kikke på hva slags genetikk som er kommet med i avlsprosjektet, og om det virkelig går an å selektere fisk for stor vekst på et tidligere tidspunkt gjennom genotyping!

Foto: Biobank

Siden ble sist oppdatert: 26. september 2018 - 13:05;